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=== 마이크로소프트에 의한 인수 ===
2010년대 중반 이후 마이크로소프트는 .NET, 파워셸(PowerShell), 비주얼 스튜디오 코드(Visual Studio Code), 윈도 계산기, 윈도 터미널 등의 오픈 소스 프로젝트와 제품 문서를 깃허브에 공개하는 등 주요 오픈 소스 활동의 중심을 깃허브로 옮기기 시작하였다. 2018년 6월 4일, 마이크로소프트는 깃허브를 75억 달러 규모의 자사 주식으로 인수할 계획이라고 공식 발표했으며,<ref>[https://news.microsoft.com/announcement/microsoft-acquires-github]</ref> 같은 해 10월 26일 인수 절차가 마무리되었다.<ref>[https://blogs.microsoft.com/blog/2018/10/26/microsoft-completes-github-acquisition]</ref> 인수 이후에도 깃허브는 독립된 브랜드와 제품 철학을 유지하는 자회사 형태로 운영되었고, 자마린(Xamarin)의 전 최고경영자였던 낫 프리드먼(Nat Friedman)이 깃허브의 최고경영자(CEO)를 맡았다.<ref>[https://www.theverge.com/2018/10/26/17954714/microsoft-github-deal-acquisition-complete]</ref>

인수 발표 당시 일부 개발자와 오픈 소스 커뮤니티에서는 마이크로소프트의 과거 인수 사례와 폐쇄적인 소프트웨어 전략을 이유로 우려를 표하기도 하였으나, 마이크로소프트는 깃허브를 오픈 소스 친화적인 플랫폼으로 유지하겠다고 강조하였다. 인수 이후에도 깃허브는 리눅스 커널, 파이썬, Node.js 등 주요 오픈 소스 프로젝트의 핵심 호스팅 플랫폼 역할을 계속 수행하고 있다.